От заморозки много чего останется жить и вредить
Мне Леня Панченко (корма Аквария) рассказывал, что не обнаружены были вобудители только в корме, который пролежал замороженным больше года. А замораживают шоколадки при гораздо более низкой температуре, чем -40.
Лучший результат дезинфекции - УФ-облучение. И то не всегда. В домашних условиях можно марганцовкой обеззараживать.