А не перекармливаете? Я знаю, по глазам золотых рыбок, они вечно есть просят...

Померять бы вам хотя бы нитриты... Золотых рыбок достать чем-то сложно, если уж им плохо, то значит совсем плохо в воде...
2 см грунта закисать будет долго, если пылесосите и воду меняете, то суть не в этом. А живого корма, кроме огурцов, не давали, не соблазнялись?