Я тоже думаю, что цвет гранита в данной ситуации совсем не при чём

Возможен вариант, что красный гранит во второй банке был плохо обработан и на нём какая-то гадость осталась.
А насчёт цвета грунта... не совсем в тему, но поделюсь опытом. Жили у меня неоны с минорами в банке с чёрным грунтом. Хорошо жили, весело... Потом поменял их местами с другими рыбами, пересадил в банку с грунтом светло- коричневым, ну почти кофе с молоком

И стало им всем грустно, стали они по углам прятаться, на глаза не показываться. Думал я, гадал, и посыпал этот светлый грунт сверху слоем чёрного. И через недельку всем опять весело и приятно, плавают резвятся по всей банке. В очередной раз подтверждение. Светлый грунт стрессует многие породы рыб. Так что принимайте к сведению, не ищите болячек в некоторых ситуациях, а о рыбном фэн-шуе и статусе-кво задумывайтесь
