По болезни - к сожалению, ничего не могу сообщить, с таким не сталкивался. Самый худший вариант развития событий - перезапуск после дезинфекции.
По водорослям, в т.ч. по "бороде" - на форуме эта тема поднималась многократно. Думаю, в разделе "Водоросли и способы борьбы с ними" Вы найдете исчерпывающую информацию. Кратко: нужно создать максимально благоприятные условия для развития высших растений, тогда они не оставят питательных веществ для водорослей и последние будут находиться в угнетенном состоянии.
Ну, и в Интернете есть масса статей. Например:
http://aquarium.webtikli.net/hobby/cirling.htm ,
http://plants.aqa.ru/index.html ,
http://plants.aqa.ru/index.html .
Успехов!