[Baks]

зкоректувати плату чи написати бутлоадер

Вань в аквапроге так и сделано,вначале зашиваем загрузчик,а затем меняем прошивку через ком порт.
И становиться ненужен программатор,точнее он нужен только один раз для зашивания загрузчика.