Обсуждаемый вопрос из разряда:
На кухне куча немытой посуды. Что мне делать?
Варианты ответа - 1. Пользоваться одноразовой посудой.
2. Каждый раз после еды мыть посуду.

Также и в Вашем случае Алена. При условии что ежедневный уход (подмена воды, использование альгицидов и т.д.) Вам не в тягость можна конечно держать и на окне, но проще наверное найти место где содержать аквариум в порядке будет гораздо легче. Тем более, что с эстетической точки зрения выиграет конечно искусственно освещаемый аквариум.