Уложить по дну , под грунт зигзагом пластиковую трубку с отверстиями и направить в нее поток из фильтра. Получится донный фильтр с противотоком. Застаиваний в грунте не будет. Но резать готовый аквариум, по моему, такая головная боль. Хотя я не стекольщик. Может и есть сейчас такие технологии.