Вода портится от семян, они начинают гнить, но это если шишки с семенами долго лежат в воде.
Во всяком случае у меня так было. Самый первый раз нарвал сухих шишек с семенами, вода имела неприятный запах. Мне посоветовали собирать без семян. Может так совпало, и семена не причём.
Деревовидний вигляд