Ю.В.,
Не у верен, в своих мыслях, но тем не менее спрошу.
Может быть такое, что при подмене (вместе с водопроводной водой) в аквариум попадает что-то, что провоцирует всплеск нитратов за счет растворения иловых отложений в аквариуме и переводит их в нитриты? Что-то кислотное может попадать?