Если вода подается под дно, то чистят при перезапусках. В противном случае сифонят грунт, и чистят по мере засорения пространства под дном.
Что-то вы путаете-забор воды идет из под фальш дна!!!! И как интересно вы собираетесь чистить пространство под фальш дном-при насыпаном на него грунте и возможно растущими растениями???