А вы фильтр промываете водой из-под крана? Если да, то лучше его промывать в воде, слитой из аквариума. Почему у вас световой день только 3 часа? Для растений этого освещения мало, попробуйте включать свет на 10 часов. Тогда растения будут хорошо себя чувствовать, а не гнить и тоже в какой-то степени очищать воду.
А еще лучше почитайте вот тут http://aquaforum.kiev.ua/forumdisplay.php?f=241
Там все описано просто и понятно. Я когда сама запускала, совершенно элементарные вопросы вызывали сложость, вплоть до того, куда вешать оборудование.
Деревовидний вигляд