Почитал по ссылке...
Что ж вариант такого шрафа возможен Если вообще не вести ничего...
В том конкретном случае это скорее либо тупо наезд либо безбашеность инспектора.
При любых раскладах суд они выиграют.
Лет 5-7 назад была такая практика, насчитывают по акту скажем 50 000 а субъект опрометчиво и говорит "не согласен платить не буду" ну а налоговая в ответ "да ради бога но мы тогда от фонаря насчитаем 500 000. Побегаете по судам и там отдадите не 50 000 а 100 000 что бы отбить эти поллимона. Так что думайте что вам выгоднее"
Но это не значит что это было систематически.
На сегодня имеем некоторую несогласованость 2-3 Законов из-за этого и возникают подобные казусы.
Возможно с принятем налогового кодекса это уйдет.
Деревовидний вигляд