Почему появляються пузырьки?

[Serpentarius]

Могу предположить следующе.
Если Вы не пользовались струбцинами или другими фиксирующими приспособлениями, то все естественно.
Полимеризация силикона начинается с поверхности и идет вглубь шва. Чем толще шов, тем более длительное время силикон находится в жидком, незаполимеризованном состоянии. И при любом смещении стекол друг относительно друга через микротрещины (но не пузыри) в уже заполимеризованной массе на поверхности, вглубь шва, где силикон еще не заполимеризовался, может попадать воздух и образовывать пузыри.
Это от марки клея не зависит. Для получения качественного клеевого шва необходимо соблюдение нескольких условий:
1. Правильное взаиморасположение стекол (они не должны соприкасаться)
2. В зависимости от высоты и толщины стекла правильный выбор зазора между стеклами, и в зависимости от этого подбор толщины и профиля шва.
3. Качественная подготовка поверхностей перед склейкой - тщательное обезжиривание с последующей сушкой.
4. Соблюдение технологии склейки и надежная фиксация стекол.
Вот, пожалуй, все. Может, еще кто-то дополнит.