О рациональности… Применительно к системам жизнеобеспечения.

Гена, я вот не пойму к чему ты ведешь. Возьмем человека. Без еды он может прожить месяц-два, а без воздуха? Разницу чувствуешь. Бактерии твои полезнявые задохнутся сто раз прежде чем помруть от голода. Но в cлучае с фильтром эти два процесса идут одновременно. Если у тебя в банке нитратов "ноль", мыкробыкы-то твои не памирають, а просто дышут - ну голодовка у них временная. И прокачка 99,9999% банки в этом случае не нужна, раз нам надо сохранить популяцию бактерий в фильтре.
Самое мудрое решение, ИМХО, поставить баллон со сжатым воздухом, который открывается при пропадании эл-ва (с) ukrj + тот самый заумный аппарат Гены с режимом работы 15 мин вкл - 30 мин выкл.