При добавлении свежей воды, вода в озере помутнеет (начнут резко развиваться одноклеточные водоросли и простейшие, то же происходит и в аквариуме). Если насос мощный, а процес чистки дна длительный, то можно и всю воду из озера выкачать, если озеро не большое. Насос нужно брать не менее 8-12 м3/ч.
У меня знакомый в бассейне с рыбой меняет 30% воды ежедневно и ничего не мутнеет.