Я думаю так:.............................................. .......В это же время коряга покрывается белым налётом - тоже бактерии ................
Это плесень, такое часто бывает, когда корягу ставишь, даже если в устоявшийся аквариум ставить корягу, то такое тоже может быть, это плесень.
Про азотный цикл не очень внимательно читали...
Бактерии Вы не увидите не вооруженным взглядом, толщина бак. пленки - от 1 до 17 мкм. (мкм. или микрон соответствует 0,001 мм и обозначает толщину пленки). Если есть желание вот можно почитать.