Ну, во-первых, она там не кипит, а спокойно парится при Т 60-70 градусов, во-вторых, там все герметично и ничто никуда не уходит, кроме накипи, которая может осаждаться на ТЭНах и на баке, в третьих, хлор в водопроводе- далеко не самое страшное
http://www.aquaforum.ua/showthread.php?t=113159 . И, наконец, правильно делаете что сливаете, т.к. нормальные производители в нормальных бойлерах всегда указывают, что самый экономичный и безопасный в плане выпадения солей жесткости режим- Т около 60 градусов. Но при этой Т там со временем таки поселяется какая-то микрофлора (подозреваю- анаэробная) и по-этому раз в несколько месяцев ему нужно давать сутки-двое при Т св 70-75 градусов. Ну и сливать немного воды, т.к. она таки может сероводородом подванивать, если долго постоит. Так что, интуиция Вас не подвела- по факту делаете правильно.