и пузырьки из него выходят очень большие - очень шумно.
Любой ! ЛЮБОЙ !! компрессор будет работать шумнее чем эти пузырьки. Тем более что Вам важна аэрация, а не размер пузырьков - или я не так понял Вашу проблему ?! Вам же нужна аэрация или пузырьки особого размера??
А насчёт того что фильтр так глубоко - так зачем его так опускать ?? Большинство фильтров располагают сразу под гладью воды, для правильного перемешивания. То же касается и внешних фильтров - все выходы (флейты, Лили Пайпы и т.п.) всегда вверху, возможно бывают исключения, и наверно даже оправданные. Если у Вас тот самый вариант - не стесняйтесь, скажите.