Но тут дело в том, что они идут даже в тех местах где я постоянно кормлю рыб при каждой подмене с сифонкой.
Ну и что - сине-зеленым времени размножиться нужно не много. Тем более, что вы сифоните раз в две недели. Если уж и пузыри с запахом я вообще тогда не могу понять, почему вы отрицаете проблему с грунтом?