Какой должен быть слой грунта?

[Морпех]

Исходные данные по назначению аквариума помогут точнее дать совет.
Если назначение "цихлидник" и растений будет мало или вообще искусственные, тогда и 4-5 см больше чем достаточно. Тем более грунт постоянно будет "перепахиваться" обитателями .
Если "травник", то тут конечно можно и до 7-8 см, но больше будет действительно перебор. Нижний слой (2-3см) практически не будет использоваться растениями, а заиливться будет прилично и "сифоном" не всегда можно подобраться...
Фильтр после запуска новой банки и засыпки свежего грунта, я бы промыл однозначно. ИМХО.