У вас большое разнообразие рыб. Когда они все вырастут (я так понял они сейчас не большие), то скаляриям и макрогнатусам кислорода будет явно мало. Желательно по возможности от некоторых рыб избавиться. При подаче СО2 фильтр обязательно включенный должен быть (он будет разносить углекислоту по всему аквариуму) А интенсивной подачи воздуха лучше избежать - в таком случае углекислота быстрее из аквы будет улетучиватся. Если рыбам кислорода будет мало, то можно из флейты (я так понял внешний фильтр) из одного отверстия вывести над поверхностью воды трубочку. Вода из неё будет попадать назад в аквариум затягивая с собой воздух. Это один из вариантов.
У меня стоит компрессор с фильтром , внутренний . Может воздух подовать после отключения света?