Диатомовые со временем могут уйти, у меня в свежезапущенном цихлиднике без живых растений примерно полгода все было коричневым, потом само очистилось.
До этого тоже в цихлиднике, при обилии диатомовых увеличил свет в два раза (до 0,7 Вт/л), водоросли ушли очень быстро, затем свет уменьшил, но диатомовые уже не вернулись.