Если царапина глубокая, то я бы стекло заменил. При полировке стекла оно будет нагреваться и перепад температур создаст микро трещинки. В результате у вас это место будет ослаблено и при повторном ударе (если ребенок раз смог поцарапать он и второй раз приложится может) может треснуть, но опять же все от серьезности самой царапины зависит, ну и от размера аквариума в частности толщины стекла.
Деревовидний вигляд