Если рыба больна то и в перезапущенной акве она будет ещё больна. Я б на вашем месте просто делал частые подмены для улучшения среды обитания рыбы.. Коль сделали перезапуск уже никуда не дется.. запускайте жильцов.. будем надеется что мальки погибали из-за плохих условий обитания, а не из-за болячки..