Амиачный запах от гниения органики (древесины) красящий эффект от гуминов скорее всего.
Два года лежала в воде и гнила в центре ствола? На утро (после того как поломал прошло часов десять) залез в ведро достал обломок все это выветрилось и при повторном смачивании цвет был однородный серый какой либо запах отсутствовал, никаких красящих не обнаружил, а сама сердцевина стала наоборот более плотной - при доступе кислорода и высыхании полимеризация?