Имеем то что имеем. Как верно сказали, рыбы погибли от азотистых (судя по времени от перезапуска- от аммиака). Сейчас он скорее всего пошел на спад, но наверняка поднялся нитрИт.
Я бы поделал подмены. Каждый день %% по 15, кормежку уменьшил бы до раз в два дня таким количеством чтобы за 30 секунд все было съедено. По возможности использовал бы токсивек от SERA, цеолит в фильтре и дважды в день добавлял бы перекись водорода (обычную, аптечную) в количестве 10 мл (медленно, на струю фильтра). И так недели три, до месяца.
Ссылки давать? Будете читать?