Уголь, как и в бытовом колбовом фильтре для питьевой воды следует класть на выход, т.к. фильтрация идёт в таком порядке:
1. Механическая через губку, синтепон и т.п.
2. Биофильтрация через биозагрузку. Бактерии "едят" растворённые в воде нитриты и т.п.
3. Уголь. Абсорбирующая фильтрация. Если поставить сорбент перед биофильтром, бактериям из п.2 будет "нечего есть".