Убирайте водоросли зубной щеткой с мест, где можно легко убрать. Там где нет растений но есть водоросли - можете закрыть тряпкой или сухим листом от света. А так я бы ничего особо не делал и не травил. Вполне нормальная эволюция. Уйдет со временем - растения должны победить.