Скорее всего инфекционное чтото...может и грибковое...
В любом случае, УФС не помешал бы...
Нитраты-нитриты убрать по максимуму - есть много вариантов - от подмен до химии
Медикоментозно лечить - также есть много вариантов... но перед лечением я бы убедился что вода не имеет переизбытка по органике, а то лекарства тогда дадут временный эффект.