Если только на теле, а не на "каркасе" (карапакс имели ввиду?), то это линька, все путем.
Не факт... В данном случае меня больше настораживает то обстоятельство, что черепахе 9 месяцев, а у нее размер панциря почти как у новорожденной!!! Она должна уже как минимум сантиметров 10 быть!!! Sined, в каких условиях Вы держите черепаху(температура воды, размер акваса)? Какой корм даете? Есть ли у нее УФ лампа?
Причиной "лохмотьев" на теле, если это продолжается более 1-2 недель, может быть грибковое заболевание.