Sendy, что Вы!.. Ни о каком втаптывании я даже не думал! Наоборот, радует желание что-то сделать и поделиться с ближним своим ноу-хау.
По сути дела Вы хотите соорудить САМП не выходя за пределы банки. Возможно у Вас всё и выйдет так как Вы планируете. Но! Отделяя часть акваса под фильтр Вы уменьшаете его полезный объём. Нолучаются ножницы: делаем большой фильтр для того что бы посадить больше рыбы, а сажать её некуда... При чистке у Вас не получится убрать грязь, не вылив часть в общий объём (проблема всех внутренников). К тому же ИМХО роль субстрата для биофильтрации несколько преувеличена. В грунте бактерий не меньше. В фильтрах бактерии позволяют ненамного увеличить население.
В чём прикол засунуть аэратор в фильтр? Думаете на всасывании кислорода не будет?
Вообще есть подозрение что Вы собираетесь делать банку не для рыб и травы, а для бактерий...

Про шум... Внешний фильтр шумит меньше внутреннего, поскольку он в тумбе и нет прямого контакта обмотки помпы с банкой.
ЗЫ Не верю что Атманы у Вас дорогие....