Просто поставьте фильтр с активированным углем. Он будет поглощать продукты обмена инфузорий и Вы поднимите малька без потерь.
только нужно сделать это заранее. "После того как" - поздно пить баржоми. Часть малька по-любому не оклемается. Кстати, перенесшие бактериальную вспышку мальки часто растут медленнее, могут иметь искривления скелета и прочие прелести.
Честно говоря, после каждого раза мутняка в малявочнике, обещал себе "обязательно ставить уголь и лампу(уф)". И каждый раз забывал о обещании. Наверна не очень нада...