Сам вентилятор работает не очень шумно. Гудит крышка вцелом
Попробуйте закрепить вентилятор не на винтики, а на мягкие аммортизаторы. Например, вентиляторы Zalman комплектуются силиконовыми аммортизаторами вместо винтов для снижения гула от корпуса компьютера. Возможно гул от крышки таким образом тоже можно заметно снизить, сделав самодельные аммортизаторы из подручных средств.