Чтобы не так разносилась муть по акве, на время ковыряния в грунте выключаю фильтр вообще. Что поднимается при посадке, большей частью тут же оседает.
А если нужно выкопать что-то из грунта, держу рядом минисифон (5 кубовый шприц и шланг от компрессора) и потихоньку выковыриваю корни, большая часть грязи уходит в сифон.
Деревовидний вигляд