Насколько я знаю историю создания самого контроллера А. Юсуповым, те функции, доступ к которым только через комп (кроме тарировки рН) были добавлены уже позже, по желанию пользователей.
По большому счету А. Юсупов мог и программный код для ATmegи переписать с уже вновь добавленными функциями. Просто не всегда и везде есть возможность и доступ для подключения компа к контроллеру.
Деревовидний вигляд