Значення Power Fail у DS3231 = 2,575В(2,45-2,70В), якщо її живити напряму від 5В, то при зниженні напруги до 2,575В подача ресету на проц вже не буде мати сенсу, тому що він і так вже зупиниться. Атмега може працювати на частоті 8МГц стабільно лише від 2,7В...
Тому пропоную живити DS3231 від 5В через два кремнієвих діоди, тоді напруга приблизно буде 3,8В, при падінні до 2,575В на атмезі буде 3,775В, чого цілком достатньо для стабільної роботи на 8МГц

П.С. Так як DS3231 споживає мікроампери, то щоб отримати спад напруги на відкритому кремнієвому діоді 0,6В потрібно забезпечити струм через діод хоча б на рівні 2-3мА. Тому з ноги Vcc DS3231 на корпус потрібно поставити резистор 1,5кОм.
З метою отримання хорошої завадостійкості подавати 5В на виводи атмеги 21 і 52 (Vcc) просто так не можна, потрібно ставити дроссель 47мкГн, до дросселя конденсатор 10мкФ і після дросселя на кожній ножці Vcc (21,52) по конденсатору 0,1мкФ
