"Имел ввиду - "когда носик" дюрсо воздух не прохватит и не прекратится слив в самп."
По-моему Вы не до конца поняли принцип работы Дюрсо. Он НИКОГДА носиком воздух не прохватывает! За счет этого обеспечивается бесшумность работы. Перелив прекращается как только уровень воды опустится до краев переливного стакана.
По-поводу погружения труб. Если будете выход труб погружать в воду (для обеспечения лучшего течения, установки дефлектора и т.д.), то на уровне поверхности воды в трубе надо просверлить небольшое отверстие, чтобы при отключении помпы вода сифоном не слилась в самп по подающей трубе до уровня выхода этой трубы (т.е. пока "носик трубы не прохватит воздух"

).
А будете Вы их погружать, или нет - тут решать Вам, в зависимости от мощности помпы, расположения декораций, места вывода в аквариум и т.д.
Подающую помпу теоретически можно отгородить сетчатым карманом, но во-первых, это более трудоемко, чем сетчатая перегородка, а во-вторых стенки кармана более вероятно забьются травой и прочим мусором, чем перегородка с большей площадью. (ИМХО).